Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch2Q3UMG5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms