Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhdc1Q3ULZ2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhdc1Q3ULZ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms