Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms