Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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