Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Mier3Q3UHF3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms