Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx27Q3UHD6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms