Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Hvcn1Q3U2S8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Hvcn1Q3U2S8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Hvcn1Q3U2S8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms