Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf149Q3U2C5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf149Q3U2C5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf149Q3U2C5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnf149Q3U2C5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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