Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms