Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf6Q3TWW8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms