Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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