Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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