Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim43aQ3TL54 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms