Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cwc27Q3TKY6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms