Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms