Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ptchd1Q14B62 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ptchd1Q14B62 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ptchd1Q14B62 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ptchd1Q14B62 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ptchd1Q14B62 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ptchd1Q14B62 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ptchd1Q14B62 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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ptchd1Q14B62 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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