Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnnm1Q0GA42 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms