Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms