Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms