Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnb1Q03717 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms