Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 552 ms