Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms