Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GscQ02591 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GscQ02591 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GscQ02591 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms