Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EgfrQ01279 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms