Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb2Q00977 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms