Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms