Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms