Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

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Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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F8a1Q00558 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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F8a1Q00558 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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F8a1Q00558 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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