Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms