Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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