Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx1P81068 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms