Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiitaP79621 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiitaP79621 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms