Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad50P70388 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms