Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gfi1P70338 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms