Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms