Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms