Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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