Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp46P62069 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp46P62069 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp46P62069 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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