Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms