Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms