Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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ActbP60710 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ActbP60710 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms