Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms