Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hps5P59438 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hps5P59438 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms