Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdhd1P59328 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms