Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms