Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samsn1P57725 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samsn1P57725 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms