Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TdgP56581 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TdgP56581 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TdgP56581 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TdgP56581 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms