Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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