Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp5P56399 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms