Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec1P51908 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec1P51908 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec1P51908 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec1P51908 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec1P51908 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec1P51908 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec1P51908 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec1P51908 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec1P51908 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms